Båtsektionen tar ut en miljöavgift som skall underhålla båthamnens miljöstation. Varje båtägare är skyldig att själv sortera sina avfall i respektive behållare. Endast bottenfärg som är godkänd ur miljösynpunkt får användas i hamnen. Miljöförvaltningen – Göteborg Stad gör regelbundna kontroller. Det är förbjudet att blästra båt vid hamnområde.
